Bilan du Réseau des Microscopistes de l’INRA

Les quatrièmes journées scientifiques et techniques du réseau des microscopistes INRA se sont tenues du 13 au 15 novembre 2013 à Champenoux, journées soutenues par le Labex ARBRE. 92 participants étaient présents, représentant les différents centre INRA.

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Le thème de ces journées était axé sur la microscopie électronique à balayage et ses outils d’analyse. Après avoir évoqué les bases de ces technologies, la préparation de tous les types d’échantillons (végétal, animal, bactérie, sol etc.) a été abordée. Les exposés et discussions entre les membres du réseau se sont enchainés avec des focus sur l’utilisation des microscopes à pression contrôlée ou l’utilisation de la microanalyse X qui permet la localisation et la quantification des éléments minéraux à l’échelle microscopique.

Des ateliers pratiques ont été mis en place (EDS, WDS, microdissecion laser, coupes cryostat, microtome, vibratome, avec la présence de 3 mini MEB de paillasse) avec aussi des visites des plateformes PTEF et Xylosciences qui soutiennent les différentes équipes du Labex ARBRE.

Veuillez cliquer ici pour le bilan complet de ces journées :

Bilan RMUI – part 1
Bilan RMUI – part 2
Bilan RMUI – part 3
Bilan RMUI – part 4
Bilan RMUI – part 5

AgreenSkills encourage la mobilité : l’appel à candidatures est ouvert

 

 

AgreenSkills est un programme de mobilité internationale vers ou depuis la France à destination des jeunes chercheurs, de toutes disciplines et sans condition de nationalité. 142 offres avec des conditions attractives d’accueil et de recrutement sont proposées sur quatre ans.

ARBRE tient à vous rappeler l’existence de ce programme de mobilité internationale qui peut apporter un cofinancement à des projets déposés dans le cadre de l’appel d’offre annuel du Labex.  ARBRE encourage tous les scientifiques à profiter de cette opportunité unique pour développer des projets collaboratifs.

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Coordonné par l’Inra et Agreenium, le programme AgreenSkills (2012-2016), est cofinancé par la Commission Européenne dans le cadre du Programme COFUND – Personnes du 7e Programme cadre de recherche et développement (PCRD).

Les objectifs d’AgreenSkills sont de favoriser la mobilité internationale des jeunes chercheurs, de 6 à 12 mois pour les séjours sortants, et de 12 à 24 mois pour les séjours entrants en France, en soutenant des projets de recherche par des compléments financiers à la mobilité très attractifs et des parcours personnalisés de développement de carrière. Il s’adresse aux jeunes chercheurs les plus brillants titulaires d’un doctorat, avec moins de 10 ans d’expérience depuis l’obtention de leur Master, sans distinction de nationalité et d’origine.

Le site du programme www.agreenskills.eu présente l’ensemble des éléments d’information relatifs au programme, conditions d’accueils, critères d’éligibilité et modalités de candidature, calendriers etc. Un accès sécurisé permettant la préparation et le dépôt de dossiers de candidature sera disponible à l’ouverture du processus de sélection.

Calendrier :

L’appel à candidatures est ouvert en continu. Il est rythmé par deux périodes de sélection par an durant les trois premières années (2012, 2013 et 2014).

Le second processus de sélection s’est clôturé le 15 mai 2013. Un troisième processus de sélection s’est clôturé le 15 novembre 2013.

– Présentation du programme (PDF, en anglais) : Présentation du programme AgreenSkills (version anglais)

Les interactions Bactéries-Champignons à l’honneur

 

 

 

 

 

Du 7 au 11 décembre 2013  s’est tenue  à Roscoff (Bretagne) la première conférence internationale Jacques Monod sur les interactions bactéries-champignons, conférence soutenue par le Labex ARBRE. Cette conférence s’intitulait « Interactions bactéries-champignons : un domaine de recherche fédérateur pour la microbiologie fondamentale et appliquée »

Ce ne sont pas moins de 77 scientifiques de 15 nationalités différentes (France, Europe, Etats-Unis, Mexique, Sri Lanka) qui ont pu appréhender la grande transversalité de cette thématique de recherche qui vit actuellement une importante montée en puissance.  Issus de différents domaines (agronomie-sylviculture, environnement, agroalimentaire, médecine, biotechnologie, biologie synthétique, patrimoine culturel), ces chercheurs ont tour à tour discuté des derniers résultats concernant l’écologie et les mécanismes des interactions entre bactéries-champignons, leurs applications et implications tous domaines confondus.

La dynamique créée par cette conférence a conduit les participants à programmer un événement similaire en 2016-2017 et à formaliser la construction d’un réseau  international de laboratoires travaillant sur cette thématique. Ce réseau est ouvert à tout nouveau laboratoire intéressé (contact A. Deveau ; deveau@nancy.inra.fr)

Le programme de la conférence est disponible sur le lien suivant :   http://www.cnrs.fr/insb/cjm/archives/2013/cjmprog.html

Pour en savoir plus, veuillez cliquer ici pour le diaporama d’introduction

L’Experimentarium en Lorraine

Une aventure partagée entre des doctorants et des enfants

La 2nde session 2013 de l’Experimentarium en Lorraine s’est achevée le 7 novembre dernier devant 45 élèves du Lunévillois véritablement captivés. Sur les six doctorants participants, cinq réalisent leur thèse dans une unité de recherche associée au Labex ARBRE (IAM, BEF ou Dynamic) et sur un sujet en lien avec la forêt. Tous ont présenté leurs recherches et leur démarche de chercheur avec un enthousiasme particulièrement communicatif.

Pour rappel, l’Experimentarium est un module de formation proposé à l’ensemble des doctorants de l’Université de Lorraine. Il leur permet de prendre du recul sur leur thèse et d’apprendre à expliquer leur démarche de recherche en termes accessibles à tous les publics. L’organisation de la formation est assurée par l’association La Vigie de l’Eau avec un fort appui de l’Inra, ainsi que le soutien des Labex ARBRE et Ressources 21.

Découvrez ici les fiches de présentation des doctorants du Labex : site La Vigie de l’Eau, site Eureka lorraine 

4èmes Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes de l’INRA


Microscopie électronique à balayage et ses outils d’analyse

13, 14 & 15 novembre 2013

Centre INRA de Nancy-Lorraine, Campus de Champenoux

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Cette année, le comité local d’organisation de Nancy animé par Didier Le Thiec vous attend au centre INRA de Nancy-Lorraine du 13 au 15 novembre pour un programme sur la microscopie électronique et ses méthodes d’analyse couplées. Des ateliers pratiques seront organisés pour que chacun puisse découvrir ces techniques, ou approfondir ses connaissances en la matière.

Ces journées ont reçu l’appui des départements de recherche Phase, BAP et EFPA de l’Inra, de la CNOC, de la formation permanente nationale de l’Inra, du Labex ARBRE, de la région Lorraine ainsi que de différents partenaires privés.

Comme l’année dernière, une session poster est proposée pour tous les participants. Nous proposons aussi un concours photos.

Veuillez cliquer ici pour la programme définitif : Programme

 

Sébastien Duplessis – La recherche forestière lorraine primée

Les alliances entre arbres et champignons à l’honneur

2ème Prix du Chercheur 2012

7 novembre 2013

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Sébastien Duplessis (unité IAM) reçoit aujourd’hui le 2ème Prix régional du chercheur de la Région Lorraine pour ses recherches sur les interactions arbres-champignons.  Jeune chercheur à l’INRA Nancy-Lorraine, Sébastien Duplessis est dans une période faste : il a été promu directeur de recherche fin 2012 et, en début d’année, il a reçu le Prix Suzanne Zivi de l’Académie de Stanislas.

Ces prix sont une reconnaissance exprimée à toute la communauté scientifique forestière lorraine et un encouragement à poursuivre nos efforts de recherche dans des domaines où nous sommes reconnus internationalement. La remise des prix régionaux de la thèse et du jeune chercheur est d’ailleurs organisée à l’occasion de deux journées consacrées aux pôles de recherche régionaux. Les axes de recherche développés par l’INRA avec ses partenaires académiques figurent en bonne place dans la stratégie régionale d’enseignement supérieur, recherche et innovation.

Pour lire plus ..

Bravo Sébastien !

WADE séminaire

Séminaire du projet Wood Acclimation to Disturbed Environments (WADE)

31 octobre à 14h00

Salle Tilleul – INRA centre de Nancy,  Champenoux

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Au programme du séminaire, quatre présentations de 20 minutes environ pour résumer les avancements des travaux liés au projet:

Integrative biomechanics for tree ecology: beyond wood density and strength .
par Meriem Fournier

Biosynthèse des parois secondaires dans le bois de peupliers soumis à des contraintes environnementales.
par Mireille Cabané

Composition du bois en plantations mélangées d’espèces fixatrices et non fixatrices d’azote: impact de la ressource en azote.
par Nicoloas Brosse

Le bois de branches et de noeds – Résultats préliminaires sur les branches d’épicéa commun. Perspectives.
par Francis Colin

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Le projet WADE
Adaptation physiologique et fonctionnelle des structures et propriétés du bois à l’ouverture du couvert

Contacts Scientifique
Jana Dlouhà, LERFORB
Meriem Fournier, LERFORB

Conférence Jacques Monod – Interactions bactéries-champignons

Conférence Jacques Monod co-organisée par l’INRA, le CNRS et le Labex ARBRE
Interactions bactéries-champignons : un domaine de recherche fédérateur pour la microbiologie fondamentale et appliquée

7-11 decembre à Roscoff (Bretagne)

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La mycologie et la bactériologie sont deux disciplines qui se sont pendant longtemps ignorées. De ce fait, champignons et bactéries ont souvent été considérés comme opérant par eux-mêmes, oubliant le fait qu’ils coexistent en de multiples environnements et forment des communautés physiquement, métaboliquement et fonctionnellement interdépendantes. Ces communautés mixtes jouent pourtant un rôle central dans un très grand nombre de secteurs parmi lesquels l’agriculture et la sylviculture, la protection de l’environnement et du patrimoine culturel, l’agroalimentaire, les biotechnologies et la médecine.

Tout au long de la Conférence, chaque question de recherche sera abordée de façon multidisciplinaire afin de catalyser l’émergence de nouvelles voies de recherche et de rassembler les chercheurs autour de questions communes.

Pour lire plus ..

Veuillez cliquer ici pour l’affiche des conférences

Master FAGE Séminaires

Programme de séminaires inter-unités soutenus par Labex ARBRE et en partenariat avec le master FAGE (Université de Lorraine – AgroParisTech).

le 8 novembre 2013

13h30 à 16h30

INRA Nancy centre, Champenoux
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Quatre séminaires se succéderont dans l’après-midi :

Jens Abildtrup (INRA Nancy-Lorraine, Laboratoire d’Economie Forestière – LEF) –
“The recreative value of forests : Assessment and policy implications”.

Raphphael Calama (Instituto Nacional de Investigacion y Tecnologia Agraria y Alimentaria INIA, Espagne) – “Research and management of nonwood forest products”.

Rubén Manso (INRA Nancy-Lorraine, Laboratoire d’Etudes des Ressources Forêt-Bois – LEFORB) – “Individual growth and mortality in mixed stands of oak and beech”.
“The recreative value of forests : Assessment and policy implications”.

Mathieu Fortin (AgroParis Tech, Laboratoire d’Etudes des Ressources Forêt-Bois – LEFORB) – “Simulating forest growth from trees to stands”.

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Présentation de master FAGE
Master Biologie et écologie pour la Forêt, l’Agronomie et l’Environnement (FAGE)
(Université de Lorraine – AgroParisTech).

L’objectif scientifique de la mention FAGE est de donner à des étudiants ayant déjà une première formation en biologie, chimie ou sciences de la terre une formation sur des concepts de biologie communs aux domaines d’application des différentes spécialités de la mention, et une maîtrise des outils (communication, expérimentation, enquête, interprétation des données, …) indispensables aux démarches de recherche et de gestion.
L’objectif de la formation est également d’amener les étudiants à intégrer les demandes sociétales liées à ces domaines d’application, et en particulier par une réflexion sur les enjeux et les outils du développement durable.

Dans une optique de biologie intégrative, la formation s’appuiera sur la biologie moléculaire et cellulaire, la microbiologie, la génétique, la physiologie et l’écophysiologie. Dans une optique d’analyse écologique, la formation permettra l’acquisition d’outils de l’écologie fonctionnelle, de la pédologie, de l’écologie des populations, des communautés et des paysages. Dans une optique d’analyse de filières et de systèmes de production, la formation enseignera la conception, la mesure et la modélisation d’indicateurs de performance et de durabilité, dans un contexte d’innovation.

La filière bois qui occupe une place importante dans l’économie régionale sera au cœur de certaines spécialités, avec la volonté de couvrir la filière de la ressource au matériau, de la biologie de l’arbre à l’insertion de la forêt dans le paysage, et avec une ouverture forte à l’international avec une spécialité en anglais et une spécialité centrée sur les forêts tropicales. Les connaissances scientifiques acquises par les étudiants seront soit orientées vers des approfondissements fondamentaux, soit reliées à la résolution de grands problèmes environnementaux.

WADE Séminaire

Alexander Kirdyanov et Marina Bryukhanova

25 octobre de 10h à 12h

Salle Tilleul – INRA centre de Nancy,  Champenoux

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Nous accueillons le 25 octobre Alexander Kirdyanov et Marina Bryukhanova du groupe de E. Vaganov (Sukachev Institute of Forests, Krasnoyarsk). E. Vaganov est un chercheur réputé sur la formation du bois et pour son livre de 2006.

Le vendredi 25 octobre ils donneront un séminaire soutenu par le projet WADe dans le Labex ARBRE (mais qui dépasse largement l’analyse de cernes).

 

Résumé Alexander Kirdyanov:
Dendro-science in Siberia. Case studies from the Tree-Ring Structure Lab (Institute of Forest, Krasnoyarsk, Russia)

Tree-rings were shown to provide comprehensive information on the environmental changes and physiology of tree functioning. The Laboratory of Tree-Ring Structure at the Sukachev Institute of Forest, Krasnoyarsk Russia is focused on extracting and interpreting this information with the goals to understand the impact of environment on tree growth and forest productivity. A short overview of some recent and current studies will be provided to show the main topics of interest and the potential of the Lab: transect studies, use of multi-proxy approach (tree-ring cell structure, density and isotope composition), studies on permafrost, etc. Examples will vary on both spatial (from one stand to continental) and temporal scale (seasonal growth with the resolution of 3-7 days to multi-millennia dendroclimatic reconstructions).

Résumé Marina Bryukhanova:
Growth of trees on permafrost: habitat driven response to climate

Global change is expected to alter boreal forest conditions with far reaching consequences for tree growth in these ecosystems. Within this study we aimed at determining which limiting factors control tree-growth on permafrost under different site conditions.
A tree-ring multi-proxy characterisation of mature Larix gmelinii (Rupr.) Rupr. from a continuous permafrost zone of Siberia (Russia, 64°18′ N, 100°11′ E) was used to identify the physiological principle of responses related to the plant-soil system. Tree-ring width (1975-2009), carbon and oxygen stable isotopes, and xylem structural characteristics (2000-2009) indicated that an increased depth of the soil active layer favors a better exploitation of the available resources.

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Le projet WADE
Adaptation physiologique et fonctionnelle des structures et propriétés du bois à l’ouverture du couvert

Contexte La variabilité de la qualité du bois est utilisée en dendrochronologie pour marquer les événements passés. Une meilleure compréhension de cette plasticité du bois demande de nouvelles approches, car les réponses de l’arbre superposent de nombreux processus. Les modèles usuels fondés sur l’observation passée ne sont pas fiables dans le contexte de changements environnementaux rapides et intenses.

Objectifs Le but de WADE est de rénover le cadre de modélisation et d’analyse de la plasticité des structures et propriétés du bois. WADE s’appuie sur les questions posées par l’acclimatation à l’ouverture du couvert, qui représente une perturbation à la fois fréquente et complexe.

Approches WADE s’appuie sur une approche multi-échelle de la structure et des propriétés du bois, depuis l’arbre entier jusqu’à la composition chimique et l’ultra-structure pariétale. WADE met en œuvre un large éventail de techniques de la dendro-écologie, de la biophysique et de la chimie du bois. Le cadre conceptuel explicitera les critères de choix des traits du bois et la signification fonctionnelle des variations observées. WADE utilise les avancées récentes de l’écophysiologie et de la biomécanique pour étudier comment les arbres réagissent aux changements du microclimat lumineux et mécanique après ouverture.

Responsable scientifique : Meriem Fournier (UMR 1092 Laboratoire d’Etude des Ressources FOrêt Bois)