Invitation à deux ateliers méthodologiques de génomique des populations

le mardi 18 novembre 2014

INRA Centre Nancy-Lorraine, Champenoux

_____________________________________________________________

Les thématiques du réseau “Génétique” du Département EFPA recouvrent l’ensemble des variations possible autour de la génétique envisagée au sein du Département : génétique des populations, génétique quantitative, amélioration et concernent tous les types de modèles (animaux, végétaux et microbiens, mais aussi théoriques).

Dans le cadre de la réunion annuelle du groupe des généticiens du Département EFPA de l’INRA et avec le soutien du Labex ARBRE, nous organisons le 18 novembre 2014 deux ateliers de formations aux méthodes d’analyse de données de génomique des populations.

Les deux ateliers sont :

• Inférence de l’histoire des populations avec la méthode Approximate Bayesian Computation (ABC) – animé par Miguel Navascuès (INRA Montpellier) et

• Détection de loci sélectionnés grâce aux scans génomiques – animé par Simon Boitard (ISYEB – UMR L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité / CNRS / Muséum national d’Histoire naturelle de Paris).

Pour plus d’informations, voir la page suivante :  EFPA Colloque Réseau Génétique – Ateliers

Dix places ont été réservées aux membres des UMR de Labex qui seraient intéressés. La formation est ouverte aux chercheurs, ingénieurs, doctorants et post-doctorants. Les bases de la génétique des populations seront utiles pour bien comprendre les concepts développés au cours de ces ateliers, mais leur objectif premier consiste à savoir appliquer les méthodes.

Si vous êtes intéressés, merci de vous manifester auprès de Stéphane De Mita (<sdemita@nancy.inra.fr>) avant le 15 octobre. Si vous ne pouvez assister qu’à une demi-journée, merci de préciser à quel atelier vous souhaiteriez participer.

Les Premières Rencontres Alternatives du Champignon

Samedi 4 octobre
________________

à l’occasion de l’inauguration du Champi’Parc

Les Petits Débrouillards du Grand Est ont l’immense plaisir de vous convier aux Premières Rencontres Alternatives du Champignon. Ils organisent, avec de nombreux partenaires engagés à nos cotés, ce Festival citoyenno-scientifique, à l’occasion de l’inauguration du Champi’Parc (samedi 4 octobre 18h). Le Champi’Parc est une champignonnière collaborative, lieu de culture de champignons, d’expérimentation de cultures, lieu de vie et d’animation scientifiques.

Les Rencontres Alternatives du Champignon ont lieu sur le Site des Brasseries à Maxéville:

• Mercredi – 1er Octobre 13-19h
• Samedi – 4 octobre 13-23h
• Dimanche – 5 octobre 13-19h

Au programme :

• Animations / Ateliers de manipulation et de construction (de capteurs numériques, de bacs à champignon, de lombricomposteurs, d’hôtels à insecte…)
• Recensement participatif de la biodiversité
• Sorties cueillettes et identification de champignons en forêt de Haye
• Projections-débat
• Soirée concert et danse…

Veuillez suivre ce lien pour plus d’informations .. 
Les Petits Débrouillards

Pour lire le programme, cliquez ici : Programme

Et ici pour la  Communiqué de presse

Annonce et appel à contributions
pour un colloque sur le thème :

Penser la multifonctionnalité du secteur forestier
dans un contexte changeant et incertain.

Les 19 et 20 novembre, FCBA – Paris

________________________________________

Le secteur forestier fait face à de grands défis sociétaux, on l’amène en particulier à :

• répondre à des attentes multiples de professionnels, d’usagers et plus généralement de la société,
• affronter des changements tout aussi variés se présentant en outre avec leur lot de risques et d’incertitudes,
• contribuer de manière visible et franche à la bio-économie dans le cadre des transitions écologique et énergétique.

Les sciences économiques, humaines et sociales ont un rôle majeur à jouer aux côtés des autres sciences pour relever ces défis. Elles apparaissent incontournables pour, notamment, raisonner les arbitrages à faire entre les différentes attentes, intégrer les changements, risques et incertitudes de toutes natures dans les stratégies et politiques relatives à la forêt, promouvoir des activités plus respectueuses de l’environnement.

C’est autour de ces questions que le réseau de sciences économiques, humaines et sociales (SEHS) d’ECOFOR vous convie à débattre les 19 et 20 novembre 2014 à Paris, exactement deux ans après le colloque organisé en 2012.

Public visé
Ce colloque s’adresse à des chercheurs, des gestionnaires et tous acteurs se sentant concernés par les relations entre forêt et société. Il vise en particulier les membres du réseau SEHS d’Ecofor mais aussi plus largement tout ceux qui s’intéressent aux sciences économiques, humaines et sociales, à leurs applications et à l’interdisciplinarité.

Programme général prévisionnel
Mercredi 19 novembre 9h30-18h00
Jeudi 20 novembre 9h30-17h00 (selon les contributions)

Inscriptions
Vous pouvez dès maintenant vous inscrire au colloque sur cette page

Appel à contributions
Ce colloque est organisé sur la base des contributions volontaires qui seront proposées. Vous pouvez soumettre une telle contribution en ligne jusqu’au 17 octobre 2014.

Informations pratiques
Lieu du colloque : Institut technologique FCBA, 10 avenue de Saint-Mandé, 75012 Paris

Nathaniel (Nate) Osborne est doctorant au sein du Département de Foresterie de Oregon State University (OSU) où il développe un projet centré sur la modélisation de la croissance chez le sapin de Douglas.

Nate vient de terminer un stage de 3 semaines dans l’unité LERFoB. Ce séjour financé par le LabEx ARBRE a permis :

• d’initier l’intégration du modèle de croissance-qualité ORGANON sous CAPSIS (du 8 au 12 septembre à AMAP à Montpellier sous la direction de François de Coligny)

• de discuter des algorithmes de détection automatique des noeuds dans les billons de résineux à l’aide de la tomographie rayons X (plateau Xylosciences) sous la direction de Francis Colin, Frédéric Mothe et Fleur Longuetaud.

Veuillez suivre ce lien pour l’interview qu’ils nous a accordée récemment : ARBRE Interview – Nate Osborne

Cette année, le Laboratoire d’Économie Forestière (LEF) organise les Journées Jeunes Chercheurs (JJC) du département SAE2 de l’INRA les 25 et 26 septembre 2014, en salle Jacamon à AgroParisTech.

Ces journées sont l’occasion pour la direction du département d’échanger avec les chercheurs récemment recrutés sur l’avancée de leurs travaux, et constituent une occasion intéressante de discussions avec des chercheurs confirmés du département et des enseignants-chercheurs invités. Les chercheurs récemment recrutés et qui n’auraient pas déjà participé à ces JJC viennent présenter leurs travaux, ainsi que les chercheurs ayant bénéficié d’un financement via l’appel d’offres du Conseil Scientifique du Département SAE2.

Télécharger le programme  : Programme JJC Nancy

Pour plus d’informations sur l’organisation de ces journées, s’adresse à Marielle Brunette: marielle.brunette@nancy.inra.fr

Comment concilier l’intensification attendue de l’exploitation de la forêt avec la préservation de sa biodiversité ? Quels indicateurs pour suivre et évaluer l’état de la biodiversité forestière ? Comment la faune et la flore répondent-elles aux modifications de la trame forestière ?

____________________________________________________________________________

Trois synthèses à destination des gestionnaires et décideurs rassemblent les éléments de réponses issus de 16 projets de recherche du programme « Biodiversité, gestion forestière et politiques publiques » (BGF) du ministère de l’Écologie :

• Synthèse n°1 – Lisières, connectivité, colonisation : la biodiversité dans l’espace et le temps forestiers.
• Synthèse n°2 – Évaluation de la gestion durable des forêts : quels indicateurs pour la biodiversité forestière ?
• Synthèse n°3 – Biodiversité, production et autres services forestiers : quels compromis pour la gestion forestière ?

Les trois synthèses sont en téléchargement libre sur le site du programme BGF : http://bgf.gip-ecofor.org

Le programme « Biodiversité, gestion forestière et politiques publiques » :

Animé par le Groupement d’intérêt public ECOFOR et soutenu par le ministère de l’Agriculture, le programme incitatif de recherche « Biodiversité, gestion forestière et politiques publiques » du ministère de l’Écologie a pour objectif de développer les connaissances nécessaires à une prise en compte effective de la biodiversité dans la gestion forestière au sens large, c’est-à-dire de l’exploitation forestière à la gestion d’espaces boisés protégés. Depuis sa création en 1996, le programme a soutenu 39 projets et généré de nombreuses publications, recueils et synthèses qui contribuent à éclairer les politiques publiques. En 2014, cinq nouveaux projets étudiant diverses facettes des interactions entre adaptation des forêts au changement climatique et préservation de la biodiversité ont été lancés.

Les organisateurs

Maxime Toussaint, Yoran Bornot, Alexandre Fruleux, Henri Cuny, Estelle Noyer, Emiline Hily, Aurélie Deroy

________________________________________________________________________

Ce séminaire de deux jours a été organisé par une équipe de doctorants et post-doctorants du Labex ARBRE. C’était une première et ce fût très clairement un succès grâce au professionnalisme de cette jeune équipe.  Le programme était organisé autour de trois temps forts : des présentations de travaux de recherches ouvertes à tous, des ateliers réservées aux doctorants et post-doctorants et un séminaire invité.

Dix-huit doctorants et post-doctorants ont ainsi présenté leur travaux devant une belle assemblée. De manière unanime, tout le monde a reconnu la richesse des échanges qui ont eu lieu et ont permis aux participants de mieux connaître les travaux des autres, les résultats obtenus ou les difficultés rencontrées. Les discussions ont dépassé la question des approches méthodologiques et des techniques expérimentales, et ont conduit à d’intéressants échanges de points de vue .

Trois ateliers ont permis d’aborder trois thèmes clés, proposés par l’équipe organisatrice (Atelier I: Changements climatiques et qualité du bois – quel impacts ? Quelles gestions ?, Atelier II: Comprendre les interactions arbres-microorganismes dans une optique d’amélioration de la production et de valorisation, Atelier III: Changements climatiques et phénomènes de migration des espèces en forêts). Ces ateliers ont permis des discussions particulièrement riches entre les doctorants et post-doctorants présents, et ont fait l’objet d’une restitution ouverte à tous.  Pour lire la restitution de chacun de ces ateliers, suivez ce lien – Restitution des ateliers

Invité pour l’occasion, Jean-Marc Galan a donné une présentation engagée sur la médiation scientifique. Chercheur au CNRS et biologiste de formation, JM. Galan a réorienté son activité sur la question de la médiation scientifique : communiquer les sciences à des auditoires variés y compris non-scientifiques. JM Galan a comparé vulgarisation et médiation scientifique. Avec des exemples emprunts de son expérience personnelle, il a présenté les principaux enjeux de la médiation scientifique, pour le public mais aussi pour les chercheurs.

Le LabEx ARBRE étudie le fonctionnement et la productivité des écosystèmes forestiers. Les objectifs sont d’essayer de comprendre leurs mécanismes, de prévoir leurs réponses face aux changements globaux et d’identifier de nouvelles pistes de préservations et de valorisations de ces écosystèmes. L’une des principales forces d’ARBRE, c’est de rassembler en son sein un éventail très large de compétences disciplinaires, permettant d’appréhender le fonctionnement des écosystèmes forestiers et l’analyse de la ressource forêt-bois à différents niveaux depuis la molécule jusqu’au paysage.

Ces journées mettent en valeur le travail des doctorants et post-doctorants des unités de recherche partenaires d’ARBRE. Elles ont pour objectifs de rapprocher les différentes disciplines et échelles d’étude du LabEx et visent à stimuler les discussions entre jeunes chercheurs via des exposés, des ateliers et une présentation de posters. Pour poursuivre dans cette optique de dialogue et d’échanges, une conférence sur la médiation scientifique sera animée par Jean-Marc Galan (CNRS, Institut Jacques-Monod/Université Paris Diderot).

RDV donc ce matin, lundi 8 septembre, à la salle de conférence de l’INRA à Champenoux.

Pour lire le programme détaillé, cliquer ici : Programme détaillé – Detailed Program

C’est la rentrée !

________________

Les élèves de quatre classes de 5ème du collège ont été accueillis début juin pour participer à la défoliation des hêtres à dans le cadre du projet Labex MEPIB-DEATH. Cet évènement a été relevé par le département EFPA et par EUREKA Lorraine. Dès la rentrée, Cathy Massonnet et Nathalie Bréda de l’UMR EEF, Pascale Frey-Klett du LabEx ARBRE et Cyril Galley du CPIE de Nancy-Champenoux rencontreront les enseignants du collèges pour organiser la suite de ce projet de recherche collaborative. Il s’agit en outre de proposer des exercices pour exploiter les mesures dendrométriques des arbres, des surfaces foliaires, de teneur en chlorophylle ce qui devrait mobiliser à la fois les enseignants en mathématiques, sciences et vie de la terre, physique et technologie. Les chercheurs en herbe vont découvrir que la recherche mobilise des connaissances acquises dans diverses disciplines. Désormais en classe de 4ème  les collégiens recevront également à nouveau la visite des chercheurs à l’automne pour un premier retour sur l’avancement des recherches et la présentation de la suite des travaux.

Veuillez suivre ce lien pour plus d’informations sur SURVIVORS

photo @ P Frey-Klett

Douglas Collaboration avec Oregon State University

31 août – 21 septembre

__________________________________________

Nous avons le plaisir d’accueillir Nathaniel Osborne du 1er au 21 septembre, thésard du Pr Doug Maguire avec Oregon State University. Tous deux sont spécialistes de la ressource et des modèles de croissance et de qualité du Douglas. Ils étaient tous les deux présents à la conférence MeMoWood de début novembre 2013.

A noter que le Pr Doug Maguire est directeur de la coopérative Douglas faisant partie du “Center for Intensive Planted-Forest Silviculture” (CIPS) qui a inspiré notre GIS “Coopérative de données sur la croissance des peuplements forestiers”.

Nathaniel profitera de son séjour pour démarrer :

–  l’incorporation du modèle de croissance-qualité ORGANON sous CAPSIS (du 8 au 12 septembre à AMAP à Montpellier sous la direction de François de Coligny)

– l’étude de la nodosité grâce à la tomographie rayons X développée à Nancy (en cours d’automatisation) sous la direction de Francis Colin, Frédéric Mothe et Fleur Longuetaud.

Il reviendra l’an prochain pour participer à l’analyse tomographique des arbres que nous aurons échantillonnés notamment dans le réseau de placettes du GIS.