Posts Tagged ‘carbohydrate-active enzymes’

Les champignons au charbon

August 22nd, 2012

Évolution : un champignon préhistorique serait à l’origine de l’arrêt de la formation du charbon

Voici le communiqué de presse de l’INRA sur notre article dans Science sur l’évolution des mécanismes de dégradation de la lignocellulose chez les champignons du groupe des Agaricomycotina: [“L’apparition, il y a environ 300 millions d’années, d’un champignon capable de détruire efficacement le bois pourrait en partie expliquer l’arrêt de la formation de charbon à base de débris végétaux à cette même période. C’est l’une des conclusions d’une étude menée par des chercheurs de l’Inra, du CNRS et des universités de Lorraine et d’Aix-Marseille dans le cadre d’un consortium international. L’étude a permis également de comprendre le processus de dégradation du bois par les champignons contemporains, ce qui devrait fortement intéresser le secteur des bioénergies.] … en savoir plus

Floudas et al. (2012) The Paleozoic origin of enzymatic lignin decomposition reconstructed from 31 fungal genomes. Science 336: 1715-1719.

 

Photo: Young fruiting body of  Fomitopsis pinicola (Red Banded Polypore) (© F Martin).

You Are What You Eat

May 22nd, 2010

cabbage-noriA nice post from by Karen Schwarzberg and Mike Gurney at Small Things Considered (The Microbe Blog) discussing a paper recently published in Nature by Hehemann et al. which reports that, in at least one particular instance, we do harbor bacteria adapted to the traditional diet of our culture. Porphyranases are glycosyl hydrolases cleaving sulphated polysaccharides of carrageenan and agar from marine algae. These enzymes found in marine bacteria are common in Japanese—and only Japanese—intestinal microbiota. The Japanese can digest their nori (Porphyra) thanks to specific strains of Bacteroides plebeius that they host. The initial acquisition of the β-porphyranase genes by B. plebeius was likely by horizontal transfer from a marine Bacteroidetes.

Hehemann, J., Correc, G., Barbeyron, T., Helbert, W., Czjzek, M., & Michel, G. (2010). Transfer of carbohydrate-active enzymes from marine bacteria to Japanese gut microbiota Nature, 464 (7290), 908-912 DOI: 10.1038/nature08937

See also my previous post on the gut metagenomics-inspired poem from the Cuttlefish Poet at The Digital Cuttlefish‘s “You are What you Eat.”

Photo: Cabbage Nori Rolls.© http://blog.fatfreevegan.com/2006/05/cabbage-nori-rolls.html